Sustav za pročišćavanje sirovog neona i helija prikuplja sirovi plin iz odjeljka za obogaćivanje neona i helija jedinice za odvajanje zraka. Uklanja nečistoće kao što su vodik, dušik, kisik i vodena para nizom procesa: katalitičko uklanjanje vodika, kriogena adsorpcija dušika, kriogena frakcija neon-helij i adsorpcija helija za odvajanje neona. Ovaj proces proizvodi plin neon i helij visoke čistoće. Pročišćeni plinski proizvodi se zatim ponovno zagrijavaju, stabiliziraju u međuspremniku, komprimiraju pomoću membranskog kompresora i na kraju pune u visokotlačne cilindre proizvoda.